Vsestranski krmilniki Joy-Con ponujajo številne presenetljive igralne izkušnje. Dva krmilnika Joy-Con je mogoče uporabljati vsak v eni roki ali skupaj kot en igralni krmilnik s pomočjo Joy-Con gripa. Prav tako jih je mogoče priklopiti na konzolo v načinu ročnega igranja ali jih deliti s prijateljem in v podprtih naslovih uživati v večigralski zabavi za dva. Vsak Joy-Con ima svoj popoln nabor gumbov in ga je mogoče uporabljati kot samostojen krmilnik, hkrati pa je opremljen z akcelerometrom in žiroskopskim senzorjem gibanja, kar omogoča neodvisno desno in levo zaznavanje gibanja.
Levi Joy-Con vsebuje gumb Capture, ki igralcem omogoča z enim klikom zajem trenutnih posnetkov zaslona njihove igre in deljenje le-teh s prijatelji prek družbenih omrežij. Desni Joy-Con pa vključuje NFC-točko za interakcijo z amiibo figuricami, kakor tudi IR-gibalno kamero, sposobno zaznavati razdaljo, oblike in gibanje bližnjih predmetov v za te funkcije posebej zasnovanih igrah. Na primer, ta funkcija lahko določi, kako daleč je igralčeva roka in kakšno obliko tvori.
Krmilniki Joy-Con predstavljajo tudi napredno funkcijo HD rumble, ki v združljivih igrah omogoča igralcem občutiti bistveno bolj realistično vibracijsko povratno informacijo kot kdaj koli prej. Učinek je tako podroben, da lahko igralci na primer občutijo vibracije posameznih ledenih kock v kozarcu, ki ga Joy-Con ravno simulira. Zahvaljujoč funkciji HD rumble bodo igralci doživeli novo raven realističnosti, nedosegljivo zgolj z vidom in sluhom!